Centrum prowadzi zaawansowane badania interdyscyplinarne na styku nauk ścisłych, humanistycznych i społecznych, takich jak fizyka, kosmologia, filozofia, historia nauki, matematyka i kognitywistyka.
Do zadań Centrum Kopernika należą również upowszechnianie nauki i edukacja. Centrum organizuje liczne wykłady dla szerokiej publiczności, debaty, prowadzi popularnonaukowy kanał Youtube.com/CopernicusCenter i serwis www.wielkiepytania.pl, a także jest współorganizatorem naukowo-kulturalnego Copernicus Festival. Prowadzi również Copernicus College, pierwszy polski portal MOOC. Pod auspicjami Centrum działa wydawnictwo Copernicus Center Press.
Dyrektorem Centrum Kopernika Badań Interdyscyplinarnych jest prof. dr hab. Bartosz Brożek
W skład Rady Centrum Kopernika wchodzą:
prof. dr hab. Michał Heller
prof. dr hab. Stanisław Kistryn
prof. dr hab. Jerzy Stelmach
dr hab. Janusz Mączka
dr Zbigniew Liana